Nadzorni odbor čine predsjednik i dva člana. Nadzorni odbor bira Skupština Komore sukladno odredbama Pravilnika o izboru tijela Komore. Nadzorni odbor razmatra i nadzire: materijalno-financijsko poslovanje i raspolaganje sredstvima Komore, transakcije prihoda i izdataka proračuna Komore, poštivanje odredaba Statuta i drugih općih akata Komore, obavlja i druge poslove koje mu povjeri Skupština Komore. Nadzorni odbor obvezan je redovito, a najmanje četiri puta godišnje, pregledati i razmotriti financijsko poslovanje Komore i razmotriti godišnja financijska izvješća. O svom radu Nadzorni odbor svake godine podnosi pisano izvješće Skupštini te predlaže usvajanje završnog računa.
Nadzorni odbor HLK-a: Prim. dr. sc. Ante Gojević, dr. med. - predsjednik Prim. Ivica Mamić, dr. med. - zamjenik predsjednika Doc. prim. dr. sc. Sanda Stojanović Stipić, dr. med.